RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ABHD3Q8WU67 409 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CYGBQ8WWM9 190 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RASD2Q96D21 266 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 WBP1Q96G27 269 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TXNDC15Q96J42 360 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 KATNB1Q9BVA0 655 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 VCXQ9H320 206 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CLCF1Q9UBD9 225 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 AASSQ9UDR5 926 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 OR14I1A6ND48 311 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TTLL8A6PVC2 850 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC16A6O15403 523 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 DNPH1O43598 174 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 HIST1H2ABP04908 130 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CD14P08571 375 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SFTPCP11686 197 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 AHCYP23526 432 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 EDNRAP25101 427 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC6A6P31641 620 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NTF4P34130 210 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GGT2P36268 569 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GIPRP48546 466 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CTXN1P60606 82 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PRPS1P60891 318 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RUNX1T1Q06455 604 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZP4Q12836 540 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MELKQ14680 651 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC17A1Q14916 467 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ACKR1Q16570 336 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 FCRLAQ7L513 359 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CD163Q86VB7 1156 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 LNX2Q8N448 690 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZNF519Q8TB69 540 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RNF128Q8TEB7 428 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 SARAFQ96BY9 339 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 Q96M85 177 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 IFT27Q9BW83 186 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 FANCFQ9NPI8 374 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 INIPQ9NRY2 104 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MED29Q9NX70 200 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 H0YAE9 185 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 H7C1C5 153 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RNF13O43567 381 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PRKYO43930 277 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 CYTIPO60759 359 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 IGHMP01871 453 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 TPOP07202 933 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 IFNGR1P15260 489 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GABRB1P18505 474 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 GRK5P34947 590 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 PTGS2P35354 604 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 LCN6P62502 163 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 EFNB1P98172 346 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 KEAP1Q14145 624 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CS-216ENST00000549221 MESTQ5EB52 335 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms