RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD49-208	ENST00000544253	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF35	P13682	527 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	PCGF2	P35227	344 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CCR4	P51679	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RIN1	Q13671	783 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	COX20	Q5RI15	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CRYAA	P02489	173 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	TFPI	P10646	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ACVR1B	P36896	505 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	SERPINF1	P36955	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	STX1B	P61266	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	FAP	Q12884	760 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	MOG	Q16653	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RAB8B	Q92930	207 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253		J3QLI3	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CLIC1	O00299	241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RAD51D	O75771	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	STAMBP	O95630	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	LGI1	O95970	557 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	GSN	P06396	782 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	GATA3	P23771	443 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	EDNRA	P25101	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	GLRX	P35754	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ASPN	Q9BXN1	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CA10	Q9NS85	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CLOCK	O15516	846 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	RAMP1	O60894	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	BCHE	P06276	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CD55	P08174	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	NPR2	P20594	1047 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	NR4A1	P22736	598 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	LIPA	P38571	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	NPTX1	Q15818	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ADRM1	Q16186	407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ANKRD49-208	ENST00000544253	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms