RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UROSP10746 265 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL2P13500 99 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TACR3P29371 465 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LSP1P33241 339 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GIPRP48546 466 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AQP5P55064 265 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DR1Q01658 176 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCP2Q13094 533 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB39AQ14964 217 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAPK14Q16539 360 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRN1LQ496H8 165 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EMBQ6PCB8 327 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPC24Q8NBT2 197 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DYRK2Q92630 601 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PMM1Q92871 262 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UPRTQ96BW1 309 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEURL3Q96EH8 262 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NOX4Q9NPH5 578 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.56□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LIPT2A6NK58 231 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CLDN24A6NM45 220 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R3G1 203 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP3D1O14617 1153 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC43A1O75387 559 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBOX5O94941 541 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB36O95755 333 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV4-59P01825 116 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PATE4P0C8F1 98 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DRD4P21917 467 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FUT4P22083 530 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PGM1P36871 562 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SERPINB8P50452 374 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF81P51508 661 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXA1P55317 472 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB1AP62820 205 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNB2P62879 340 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF141Q15928 474 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNC50Q53HI1 259 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESCO2Q56NI9 601 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZTK2 550 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTRT1Q8TDG2 376 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSSK3Q96PN8 268 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR7D2Q96RA2 312 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF382Q96SR6 550 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 REEP4Q9H6H4 257 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RCE1Q9Y256 329 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPTNQ9Y639 398 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RYR1P21817 5038 aa8.55□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR37O15354 613 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF208O43345 1280 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XPNPEP2O43895 674 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEC22BO75396 215 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT-ND5P03915 603 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 P2RY4P51582 365 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC3A1Q07837 685 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BNIP2Q12982 314 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPRNQ5BIV9 151 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CARD17Q5XLA6 110 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYS1Q717R9 158 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CMIPQ8IY22 773 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPICQ8N5J4 248 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM86BQ8N661 226 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.54□□□□□ -1.04
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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