RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 GSTM3P21266 225 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 BMP5P22003 454 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 AHCYP23526 432 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 SIRPAP78324 504 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 TSPAN31Q12999 210 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZBED5Q49AG3 693 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 SVOPLQ8N434 492 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 LILRB4Q8NHJ6 448 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 S100A14Q9HCY8 104 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 TAS2R5Q9NYW4 299 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 PROCRQ9UNN8 238 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 OR6C65A6NJZ3 312 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 MSTNO14793 375 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CLDN14O95500 239 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 GSSP48637 474 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 RELNP78509 3460 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PRG6 482 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 UNC119BA6NIH7 251 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 H3BNX3 289 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CDC42EP2O14613 210 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ANXA8P13928 327 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ALG10Q5BKT4 473 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 VWA1Q6PCB0 445 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 OR13C2Q8NGS9 318 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 APH1AQ96BI3 265 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 STARD4Q96DR4 205 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 NTN4Q9HB63 628 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 INIPQ9NRY2 104 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 SIGLEC7Q9Y286 467 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 FREM1Q5H8C1 2179 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 HCFC1P51610 2035 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFB2O95178 105 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 OR3A2P47893 321 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ASCL1P50553 236 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 DAP3P51398 398 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 COX10Q12887 443 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 JKAMPQ9P055 326 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 FLNCQ14315 2725 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 TRAV27A0A087WT01 109 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 C11orf98E9PRG8 122 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 HPRP00739 348 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF23P17027 643 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 AQP2P41181 271 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 PCYT1AP49585 367 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 IST1P53990 364 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CASP12Q6UXS9 341 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 AAED1Q7RTV5 226 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF100Q8IYN0 542 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 OR51A7Q8NH64 312 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 FANK1Q8TC84 345 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 KIF17Q9P2E2 1029 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 G3V2T6 193 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 CGAP01215 116 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 IGHMP01871 453 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 SMARCD3Q6STE5 483 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRK-218ENST00000525459 TFAP2EQ6VUC0 442 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.2 ms