RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515711.1

LMNA-224, Transcript of lamin A/C, human

TSL 5

Gene LMNA, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMNA-224	ENST00000515711	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	KLHL1	Q9NR64	748 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	INIP	Q9NRY2	104 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	MOK	Q9UQ07	419 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	VDAC3	Q9Y277	283 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	PCSK5	Q92824	1860 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711		A0A1W2PPW3	197 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	C2orf72	A6NCS6	295 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711		J3QRE1	110 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711		P04436	131 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ADRA2A	P08913	450 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	CPE	P16870	476 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	UGT2B10	P36537	528 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	SERPINB10	P48595	397 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	CENPA	P49450	140 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	SLC16A1	P53985	500 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ERVK-25	P63136	954 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	TUBA1B	P68363	451 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711		Q0VFX4	171 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ZP4	Q12836	540 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	PON3	Q15166	354 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ACER2	Q5QJU3	275 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	TUBA1A	Q71U36	451 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	AMER2	Q8N7J2	671 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	UFD1	Q92890	307 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	PTP4A1	Q93096	173 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	MED20	Q9H944	212 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711		A0A1W2PNV4	684 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711		A0A1W2PRG6	482 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	DAPL1	A0PJW8	107 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711		A6NIZ1	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711		J3QKU1	62 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	XKRY	O14609	159 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	RNF13	O43567	381 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	GLCE	O94923	617 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	SBK2	P0C263	348 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	LIMS3	P0CW19	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	LIMS4	P0CW20	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	CCL3	P10147	92 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	TFPI	P10646	304 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	LIF	P15018	202 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	F8A1	P23610	371 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	GRPR	P30550	384 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	BLVRA	P53004	296 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	TAS2R43	P59537	309 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	RAP1B	P61224	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ACTA2	P62736	377 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	RAP1A	P62834	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ACTG2	P63267	376 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	HSF2	Q03933	536 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	GALE	Q14376	348 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	GXYLT1	Q4G148	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	SLC6A19	Q695T7	634 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	LEG1	Q6P5S2	330 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	USP43	Q70EL4	1123 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	ZNF843	Q8N446	348 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	OR2T4	Q8NH00	348 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	NKD1	Q969G9	470 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LMNA-224	ENST00000515711	RASD2	Q96D21	266 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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