RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-215	ENST00000510074	RNF130	Q86XS8	419 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PPCS	Q9HAB8	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074		A0A096LPI6	279 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074		A0A1W2PPW3	197 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	FRS3	O43559	492 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	HLA-H	P01893	362 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	NAT2	P11245	290 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	SERPINB5	P36952	375 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ASIC5	Q9NY37	505 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074		J3QLI3	93 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074		M0R3G1	203 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PLPP2	O43688	288 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	SEC14L2	O76054	403 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PNMT	P11086	282 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF35	P13682	527 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ADRA2C	P18825	462 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	LSP1	P33241	339 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	SELENOV	P59797	346 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	MVK	Q03426	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	CASP8	Q14790	479 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	MSMP	Q1L6U9	139 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	SMU1	Q2TAY7	513 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	RAB39B	Q96DA2	213 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	CDC14B	O60729	498 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	HKR1	P10072	659 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	S100A3	P33764	101 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	RAD52	P43351	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	MIDN	Q504T8	468 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	PANX1	Q96RD7	426 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-215	ENST00000510074	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	NPIPB7	O75200	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	RAB36	O95755	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	C1QC	P02747	245 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	AVPI1	Q5T686	147 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	CARD17	Q5XLA6	110 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-215	ENST00000510074	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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