RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOL3O95236 402 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 AK1P00568 194 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 HLA-DPB1P04440 258 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD3EP07766 207 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 CT62P0C5K7 136 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSTT2P0CG29 244 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GSTT2BP0CG30 244 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIMS3P0CW19 117 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIMS4P0CW20 117 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 HPGDP15428 266 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.62e-11■■■■□ 21.5
ARHGEF3-215ENST00000498517 HTR1FP30939 366 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GABRA5P31644 462 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GABRA3P34903 492 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDOSTP39656 456 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR4P46093 362 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 RFX2P48378 723 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRG3P56975 720 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 BAK1Q16611 211 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NDUFA5Q16718 116 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NXNL2Q5VZ03 156 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 MZT2AQ6P582 158 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF836Q6ZNA1 936 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 COX15Q7KZN9 410 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NDUFAF7Q7L592 441 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 SHFQ7M4L6 423 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GDF7Q7Z4P5 450 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GID4Q8IVV7 300 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NKAIN4Q8IVV8 208 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NRMQ8IXM6 262 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 KLHL36Q8N4N3 616 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 COX18Q8N8Q8 333 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR2T33Q8NG76 320 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR5L2Q8NGL0 311 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR2Y1Q8NGV0 311 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC2A12Q8TD20 617 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 DOK4Q8TEW6 326 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TM9SF4Q92544 642 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TSLPQ969D9 159 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM203Q969S6 136 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NACC2Q96BF6 587 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC35A4Q96G79 324 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 DIRAS2Q96HU8 199 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 IP6K3Q96PC2 410 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 STACQ99469 402 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB126Q9BYW3 111 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPK1Q9H3S4 243 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 FN3KQ9H479 309 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIGUQ9H490 435 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM165Q9HC07 324 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEK6Q9HC98 313 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 Q9N2J8 555 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIGARQ9NQ88 270 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASB6Q9NWX5 421 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL20Q9NYY1 176 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NTMQ9P121 344 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 POU2F3Q9UKI9 436 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 WDR45Q9Y484 360 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NUP210LQ5VU65 1888 aa5.08□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPTBN2O15020 2390 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRAPPC13A5PLN9 417 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC182A6NF36 153 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 UNC119BA6NIH7 251 aa5.07□□□□□ -1.6
ARHGEF3-215ENST00000498517 GABRPO00591 440 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms