RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.91■□□□□ 0.14
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MED16Q9Y2X0 877 aa15.91■□□□□ 0.14
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZP2Q05996 745 aa15.89■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR176Q14439 515 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DUSP6Q16828 381 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52N1Q8NH53 320 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEURL3Q96EH8 262 aa15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SGPP1Q9BX95 441 aa15.88■□□□□ 0.13
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