RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 FXNQ16595 210 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 MIDNQ504T8 468 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 RNF130Q86XS8 419 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 TEX29Q8N6K0 151 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 ASIC5Q9NY37 505 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 MID2Q9UJV3 735 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 RCE1Q9Y256 329 aa15.97■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 CDHR4A6H8M9 788 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 SMIM23A6NLE4 172 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 SLC43A1O75387 559 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 PRG2P13727 222 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 UQCRBP14927 111 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 ANPEPP15144 967 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF43P17038 809 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 MAGEB1P43366 347 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 MVKQ03426 396 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 PIGFQ07326 219 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 CASP8Q14790 479 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 AVPI1Q5T686 147 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 WBP2NLQ6ICG8 309 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 NANPQ8TBE9 248 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 OPN4Q9UHM6 478 aa15.96■□□□□ 0.15
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 CDC14BO60729 498 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 FSHBP01225 129 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 CD79AP11912 226 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 EGR4Q05215 589 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 VRK2Q86Y07 508 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 LRRC17Q8N6Y2 441 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 MFSD8Q8NHS3 518 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 OXGR1Q96P68 337 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 OR2M2Q96R28 347 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 DPY30Q9C005 99 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF224Q9NZL3 707 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 DUSP13Q9UII6 198 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 CHST2Q9Y4C5 530 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 NOTCH1P46531 2555 aa15.95■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 A0A0G2JMP0 313 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 A0A0X1KG70 313 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 PRSS23O95084 383 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 AQP5P55064 265 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 CHI3L2Q15782 390 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 COX20Q5RI15 118 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ANXA8L1Q5VT79 327 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 REP15Q6BDI9 236 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF836Q6ZNA1 936 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 TMEM123Q8N131 208 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 STK35Q8TDR2 534 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 LRRC58Q96CX6 371 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 DUX5Q96PT3 197 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.94■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 J3QLI3 93 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 M0R3G1 203 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ZP4Q12836 540 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 GNA13Q14344 377 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 GSG1Q2KHT4 349 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 DCAF12L2Q5VW00 463 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ATG16L1Q676U5 607 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 WDFY1Q8IWB7 410 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF385DQ9H6B1 395 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 AKTIPQ9H8T0 292 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 NTN4Q9HB63 628 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 CORINQ9Y5Q5 1042 aa15.93■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 AHSA1O95433 338 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 CLPTM1O96005 669 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 IGHV2-5P01817 119 aa15.92■□□□□ 0.14
LINC00888-201ENST00000468380 NR2F1P10589 423 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms