RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 TSSK3Q96PN8 268 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 OR7D2Q96RA2 312 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 GPR35Q9HC97 309 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 LIPT2A6NK58 231 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 AQP7P3A6NL99 342 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 AP3D1O14617 1153 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF208O43345 1280 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SPRY3O43610 288 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SLC43A1O75387 559 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 STX11O75558 287 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 LCKP06239 509 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CHRM4P08173 479 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 KRT16P08779 473 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CD80P33681 288 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 PGM1P36871 562 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 HTR3AP46098 478 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 GIPRP48546 466 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 FOXA1P55317 472 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CALCOCO2Q13137 446 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 NAB1Q13506 487 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF141Q15928 474 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 MAPK14Q16539 360 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 FXNQ16595 210 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 EMBQ6PCB8 327 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM237Q96Q45 408 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 DIRC2Q96SL1 478 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 NPHS2Q9NP85 383 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SERTM1A2A2V5 107 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CLDN24A6NM45 220 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 H0YL77 283 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 M0R3G1 203 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CFLARO15519 480 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 GPR137BO60478 399 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CRCPO75575 148 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 RAB36O95755 333 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 PLATP00750 562 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SBK3P0C264 359 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 TAC1P20366 129 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 DRD4P21917 467 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CXCR1P25024 350 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEA4P43358 317 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SLC6A9P48067 706 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 AQP5P55064 265 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 PKNOX1P55347 436 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ERVS71-1P61550 626 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 RAB1AP62820 205 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 PAX8Q06710 450 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SLC3A1Q07837 685 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 BNIP2Q12982 314 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 LCP2Q13094 533 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 RAB39AQ14964 217 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CARD17Q5XLA6 110 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 Q6YL49 198 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CMIPQ8IY22 773 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 SLC35F6Q8N357 371 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-222ENST00000449504 ITPKCQ96DU7 683 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms