RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446439.1

RPS29P28-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P28, Length 141 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P28-201ENST00000446439 RGS1Q08116 209 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 MGAT3Q09327 533 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC10A7Q0GE19 358 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TWF1Q12792 350 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CHIT1Q13231 466 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SNTA1Q13424 505 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CAMK2DQ13557 499 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TDGQ13569 410 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 OR2F1Q13607 317 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 PDE7AQ13946 482 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SCARB2Q14108 478 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 VGLL4Q14135 290 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SERTAD2Q14140 314 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 GRB7Q14451 532 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 HNF4GQ14541 408 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF345Q14585 488 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ABRAXAS2Q15018 415 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TRAM2Q15035 370 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 PON3Q15166 354 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FCN2Q15485 313 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 MED22Q15528 200 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 OR4D1Q15615 310 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CHRNA6Q15825 494 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SSX1Q16384 188 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TAF12Q16514 161 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SNAPC1Q16533 368 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 MICBQ29980 383 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF284Q2VY69 593 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ODF3L2Q3SX64 289 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 LRIT3Q3SXY7 679 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CDNFQ49AH0 187 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CCSMST1Q4G0I0 132 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CDONQ4KMG0 1287 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 BCL7AQ4VC05 210 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC39A12Q504Y0 691 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 PYDC2Q56P42 97 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF805Q5CZA5 627 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CARD16Q5EG05 197 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM76BQ5HYJ3 339 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 C10orf120Q5SQS8 335 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 GCNT6Q5T4J0 391 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM72AQ5TYM5 149 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM46CQ5VWP2 391 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SAXO2Q658L1 398 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM198Q66K66 360 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 C12orf73Q69YU5 71 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 HBMQ6B0K9 141 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 GPR139Q6DWJ6 353 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CLEC6AQ6EIG7 209 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM71E1Q6IPT2 247 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ADNP2Q6IQ32 1131 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM72DQ6L9T8 149 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 CES5AQ6NT32 575 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ADAM5Q6NVV9 412 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 C3orf33Q6P1S2 294 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF613Q6PF04 617 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 DOK6Q6PKX4 331 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 DEGS2Q6QHC5 323 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TBPL2Q6SJ96 375 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM207Q6UWW9 146 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM131AQ6UXB0 335 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 LRRN1Q6UXK5 716 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SLC36A4Q6YBV0 504 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 MOB2Q70IA6 237 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 BTN2A1Q7KYR7 527 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 NDUFAF7Q7L592 441 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 GDPD3Q7L5L3 318 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 SHFQ7M4L6 423 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ZNF550Q7Z398 422 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 C16orf62Q7Z3J2 963 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 PRSS42Q7Z5A4 293 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ADCK2Q7Z695 626 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 KRT77Q7Z794 578 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 PXKQ7Z7A4 578 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TSPAN33Q86UF1 283 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 GPAT4Q86UL3 456 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TAC4Q86UU9 113 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TMEM17Q86X19 198 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 FAM72BQ86X60 149 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 EPHX4Q8IUS5 362 aa1.03□□□□□ -2.24
RPS29P28-201ENST00000446439 MISPQ8IVT2 679 aa1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms