RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 CYB5R2Q6BCY4 276 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 WBP2NLQ6ICG8 309 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ADGRG3Q86Y34 549 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ARMC8Q8IUR7 673 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 SLC30A8Q8IWU4 369 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 TUSC5Q8IXB3 177 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 FBXL14Q8N1E6 418 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 SMYD1Q8NB12 490 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ARL5BQ96KC2 179 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 TRIM15Q9C019 465 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 CBLN4Q9NTU7 201 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.29□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.28□□□□□ -0.765e-19■■■□□ 18.1
PRAME-210ENST00000442481 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ABCD4O14678 606 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 SRD5A1P18405 259 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 PTAFRP25105 342 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 PRKAR1BP31321 381 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 GZMKP49863 264 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 CCNIQ14094 377 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 FXNQ16595 210 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 LCN8Q6JVE9 175 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 SPATA24Q86W54 205 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 ELOA3Q8NG57 546 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 SLC26A7Q8TE54 656 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 FAM168AQ92567 244 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 PROX1Q92786 737 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 DHRS9Q9BPW9 319 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 BCO1Q9HAY6 547 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 CHST2Q9Y4C5 530 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 V9GYQ6 96 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.28□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 CADP27708 2225 aa10.27□□□□□ -0.76
PRAME-210ENST00000442481 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 DPRXA6NFQ7 191 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FAAHO00519 579 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TPST1O60507 370 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PMS2P2O95744 297 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SERPINA1P01009 418 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 KDELR2P33947 212 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 TTKP33981 857 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 OR3A2P47893 321 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ACTR3P61158 418 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CHRNB3Q05901 458 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 OR7A5Q15622 319 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LIPNQ5VXI9 398 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF544Q6NX49 715 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF100Q8IYN0 542 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 MUC15Q8N387 334 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 NEUROG1Q92886 237 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PSD2Q9BQI7 771 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PRR14Q9BWN1 585 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CACNG6Q9BXT2 260 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SELENONQ9NZV5 590 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 EMC3Q9P0I2 261 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PLCE1Q9P212 2302 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 SHISA9B4DS77 424 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 H7C417 338 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 M0QX08 132 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 M0R3H8 397 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF208O43345 1280 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 GPRIN2O60269 458 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LMX1BO60663 402 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CYTIPO60759 359 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 NDUFS7O75251 213 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ENTPD5O75356 428 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 LYZL6O75951 148 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 ZNF682O95780 498 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CD8AP01732 235 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 PTNP21246 168 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
PRAME-210ENST00000442481 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms