RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEURL2Q9BR09 285 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TTYH2Q9BSA4 534 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRI1Q9BV20 369 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SRRQ9GZT4 340 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR51V1Q9H2C8 321 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 RERGLQ9H628 205 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLE4Q9NR33 117 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ENAMQ9NRM1 1142 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 C20orf141Q9NUB4 165 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GX78 115 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD61A6NGH8 418 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM183AA6NL82 134 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM25AB3EWG3 89 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM25CB3EWG5 89 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM25GB3EWG6 89 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 NPIPB9F8W1W9 429 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 WWP2O00308 870 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTDSP2O14595 271 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 IMPA2O14732 288 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDCD5O14737 125 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARPC3O15145 178 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF264O43296 627 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLPP2O43688 288 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 GATBO75879 557 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 LYPD3O95274 346 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL33O95760 270 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIST1H2ABP04908 130 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CD1AP06126 327 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADRA2AP08913 450 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCL4P13236 92 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 S1PR1P21453 382 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPICP45877 212 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPTEP56180 551 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 NRG3P56975 720 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 PITPNAQ00169 270 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 RELBQ01201 579 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 RIN1Q13671 783 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC6A19Q695T7 634 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 BICRALQ6AI39 1079 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPR139Q6DWJ6 353 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL9Q6T311 187 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRSS42Q7Z5A4 293 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 MISPQ8IVT2 679 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CADM3Q8N126 398 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 C10orf53Q8N6V4 93 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEX19Q8NA77 164 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYT14Q8NB59 555 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM71CQ8NEG0 241 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 BBS1Q8NFJ9 593 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 OR51A7Q8NH64 312 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNX33Q8WV41 574 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMPDL3BQ92485 455 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TM9SF4Q92544 642 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 PMEPA1Q969W9 287 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 C4orf36Q96KX1 117 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TEAD3Q99594 435 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 CMKLR1Q99788 373 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 TM9SF2Q99805 663 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 BARHL1Q9BZE3 327 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLITRK2Q9H156 845 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADGRL4Q9HBW9 690 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 ABCB9Q9NP78 766 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 KLHL1Q9NR64 748 aa5.74□□□□□ -1.49
SHQ1P1-201ENST00000437111 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms