RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428021.1

VRK2-204, Transcript of vaccinia related kinase 2, humanhuman

TSL 4

Gene VRK2, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK2-204ENST00000428021 ITPR3Q14573 2671 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 ZNF682O95780 498 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 SERPINA1P01009 418 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 THRBP10828 461 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 ART1P52961 327 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 SLC25A3Q00325 362 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 PUDPQ08623 228 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 KRT72Q14CN4 511 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 ACKR1Q16570 336 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 FXNQ16595 210 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 SSX8Q7RTT4 187 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 UEVLDQ8IX04 471 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 TMEM123Q8N131 208 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 RNF148Q8N7C7 305 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 OR52N5Q8NH56 324 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 TMEM255BQ8WV15 326 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 BOD1Q96IK1 185 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 TXNDC15Q96J42 360 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 OR2M2Q96R28 347 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 FOXC2Q99958 501 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 FKRPQ9H9S5 495 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 NGBQ9NPG2 151 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 TAS2R5Q9NYW4 299 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 ADA2Q9NZK5 511 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 CD300AQ9UGN4 299 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 DSCAMO60469 2012 aa14.65□□□□□ -0.06
VRK2-204ENST00000428021 A0A1W2PR80 420 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 J3KTA2 159 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 FFAR1O14842 300 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 MT-ND1P03886 318 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 IL1RL1Q01638 556 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 TGFBR3Q03167 851 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 BSPH1Q075Z2 132 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ZP4Q12836 540 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 KEAP1Q14145 624 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 IFI44LQ53G44 452 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 GLYATQ6IB77 296 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 PXKQ7Z7A4 578 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 PFN4Q8NHR9 129 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 TMEM239Q8WW34 195 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 FAM162AQ96A26 154 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 PRRC1Q96M27 445 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 NANSQ9NR45 359 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 MED29Q9NX70 200 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 NOX1Q9Y5S8 564 aa14.64□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 SLC43A1O75387 559 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 KRT33AO76009 404 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 PRSS23O95084 383 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 IGF2P01344 180 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 IFNW1P05000 195 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ADORA3P0DMS8 318 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 HSD17B1P14061 328 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 AHCYP23526 432 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 CDRT15Q96T59 188 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 EMC6Q9BV81 110 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.63□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 VPS13CQ709C8 3753 aa14.62□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 SLC35F4A4IF30 521 aa14.62□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 C11orf98E9PRG8 122 aa14.62□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 HS3ST1O14792 307 aa14.62□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 OR7A10O76100 309 aa14.62□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 CD3EP07766 207 aa14.62□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
VRK2-204ENST00000428021 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms