RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 CHRNB3Q05901 458 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 NFYCQ13952 458 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM169BQ8N8A8 192 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 SCAIQ8N9R8 606 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 PIK3C3Q8NEB9 887 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 RNF217Q8TC41 542 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC38A2Q96QD8 506 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM43Q9BTV4 400 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 KATNB1Q9BVA0 655 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 MRGBPQ9NV56 204 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 MOKQ9UQ07 419 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 SSX4O60224 188 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 TPST2O60704 377 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 DSCR9P59020 149 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 RAB35Q15286 201 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF613Q6PF04 617 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 GPR137CQ8N3F9 429 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 SMYD1Q8NB12 490 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGDIGQ99819 225 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 KCNS3Q9BQ31 491 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 ASPNQ9BXN1 380 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 INAFM1C9JVW0 142 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 M0QX08 132 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 NQO1P15559 274 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 CDH12P55289 794 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 IL1RL1Q01638 556 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 KRTAP1-1Q07627 177 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 SELPLGQ14242 412 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 UEVLDQ8IX04 471 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 RHNO1Q9BSD3 238 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 NELFAQ9H3P2 528 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD54-203ENST00000407117 CRYAAP02489 173 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 BGLAPP02818 100 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 DUSP7Q16829 419 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM123Q8N131 208 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2M2Q96R28 347 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 MCHR1Q99705 422 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 GPR35Q9HC97 309 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 MS4A18H0YCH9 400 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 SASH3O75995 380 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CBLP22681 906 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 PCGF2P35227 344 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 ARF1P84077 181 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CLEC2AQ6UVW9 174 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 NOX1Q9Y5S8 564 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 JMJD1CQ15652 2540 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A096LPE4 126 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A1W2PPZ6 126 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 M0R3H8 397 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CHP2O43745 196 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 MT-ATP6P00846 226 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 IGLV1-44P01699 117 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 OPN1SWP03999 348 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 TP53P04637 393 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 PUDPQ08623 228 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 PMS2P3Q13401 168 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CEACAM16Q2WEN9 425 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC36Q8IYA8 594 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 GPR32P1Q8NGA4 272 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 OR10H5Q8NGA6 315 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 LRR1Q96L50 414 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CRLF2Q9HC73 371 aa24.18■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 HPRP00739 348 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 IGKV3-15P01624 115 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 LINC00114Q6XXX2 140 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 C10orf53Q8N6V4 93 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 OR6T1Q8NGN1 323 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 OR10A6Q8NH74 314 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 RASSF5Q8WWW0 418 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 MOGAT1Q96PD6 335 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 SH3GL1Q99961 368 aa24.17■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CECR9P0C854 216 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CBR1P16152 277 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 EFNA4P52798 201 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 NAAAQ02083 359 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 SWI5Q1ZZU3 235 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 COQ5Q5HYK3 327 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 ENTPD8Q5MY95 495 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 PXKQ7Z7A4 578 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 CA10Q9NS85 328 aa24.16■■□□□ 1.46
ANKRD54-203ENST00000407117 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms