RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379019.5

GPCPD1-201, Transcript of glycerophosphocholine phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPCPD1, Length 5,489 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1-201ENST00000379019 RD3LP0DJH9 198 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 CTSEP14091 401 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 DPP4P27487 766 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 NDUFS1P28331 727 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 AKR1C3P42330 323 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 KCNJ3P48549 501 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 SHBQ15464 509 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 KRT78Q8N1N4 520 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 RDH8Q9NYR8 311 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 POMT2Q9UKY4 750 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 A8MVJ9 347 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ARPC5O15511 151 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 FGF2P09038 288 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 FBXO45P0C2W1 286 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 CLLU1Q5K131 121 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 THEM6Q8WUY1 208 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 GLYATL1Q969I3 302 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 TEAD3Q99594 435 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ZPBPQ9BS86 351 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ZFPL1O95159 310 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 M6PRP20645 277 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 PYCR1P32322 319 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 RFX3P48380 749 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 DUSP5Q16690 384 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 RNLSQ5VYX0 342 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ZNF425Q6IV72 752 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 LIN54Q6MZP7 749 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 DEFB124Q8NES8 71 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 OR13H1Q8NG92 308 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 RGMAQ96B86 450 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 C10orf90Q96M02 699 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 OR2M4Q96R27 311 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 LRIT2A6NDA9 550 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 FAM25AB3EWG3 89 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 FAM25CB3EWG5 89 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 FAM25GB3EWG6 89 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 H7C1C5 153 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 J3QLW9 94 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ZNF19P17023 458 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 DNASE1P24855 282 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 GSTM5P46439 218 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 LCN6P62502 163 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 MED27Q6P2C8 311 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 APOOLQ6UXV4 268 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 WDR34Q96EX3 536 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 OR7D2Q96RA2 312 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 GSX2Q9BZM3 304 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 SPDEFO95238 335 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 CCKBRP32239 447 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 HNMTP50135 292 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 OR10K2Q6IF99 312 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 SLC27A4Q6P1M0 643 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 OR8K3Q8NH51 312 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 OR5W2Q8NH69 310 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 RAB33BQ9H082 229 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 NCOR1O75376 2440 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 LDB3O75112 727 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 C8GP07360 202 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 GPR1P46091 355 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 GCGRP47871 477 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 PITPNBP48739 271 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 HGFACQ04756 655 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 NNATQ16517 81 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 OR56B4Q8NH76 319 aa6.68□□□□□ -1.34
GPCPD1-201ENST00000379019 HYLS1Q96M11 299 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms