RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373115.4

CHST3-201, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST3, Length 6,970 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3-201ENST00000373115 LTB4RQ15722 352 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SYT9Q86SS6 491 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ARV1Q9H2C2 271 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 HBE1P02100 147 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SNCAP37840 140 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR8B8Q15620 311 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 DPPA4Q7L190 304 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SCD5Q86SK9 330 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ALG12Q9BV10 488 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR8U8P0C7N1 319 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 LAP3P28838 519 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 INHBCP55103 352 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CATR1Q13166 79 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 FCN2Q15485 313 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 RNF141Q8WVD5 230 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 RAB39BQ96DA2 213 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CALHM2Q9HA72 323 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 THBS1P07996 1170 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF728P0DKX0 622 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GINS3Q9BRX5 216 aa14.48□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 TMEM235A6NFC5 223 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PLK5Q496M5 336 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 S100A7AQ86SG5 101 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NECAP1Q8NC96 275 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR2T27Q8NH04 317 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF480Q8WV37 535 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 C14orf79Q96F83 325 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 G3V3Y1 287 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 KCNJ10P78508 379 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ARNTLO00327 626 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CCSO14618 274 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 DEFA4P12838 97 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 CNR1P21554 472 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC1A3P43003 542 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC35A2P78381 396 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ST8SIA2Q92186 375 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 YIPF5Q969M3 257 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NMNAT3Q96T66 252 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GAREM2Q75VX8 874 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GABRA4P48169 554 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 EMC10Q5UCC4 262 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SSX9Q7RTT3 188 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 TMEM200AQ86VY9 491 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR6V1Q8N148 313 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 FGGYQ96C11 551 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SCG5P05408 212 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 TSPAN31Q12999 210 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 STEAP1BQ6NZ63 245 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 V9GYS6 101 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NPY4RP50391 375 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 KIAA1024LP59773 190 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GAB3Q8WWW8 586 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC35B4Q969S0 331 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SLC5A2P31639 672 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SIRPAP78324 504 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 ZNF92Q03936 586 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 OR2T11Q8NH01 316 aa14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CHST3-201ENST00000373115 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms