RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 DPRXA6NFQ7 191 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 C11orf98E9PRG8 122 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 SERPINI2O75830 405 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CD53P19397 219 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 DNASE1P24855 282 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ART1P52961 327 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 NR1H2P55055 460 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 NCMAPQ5T1S8 102 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 UEVLDQ8IX04 471 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 WDR31Q8NA23 367 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 TXNDC15Q96J42 360 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 MUS81Q96NY9 551 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 OR2M2Q96R28 347 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM204Q9BSN7 226 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 EMC6Q9BV81 110 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 SLC19A3Q9BZV2 496 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 FKRPQ9H9S5 495 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 C20orf141Q9NUB4 165 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 MED29Q9NX70 200 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 RHCGQ9UBD6 479 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ADAM21Q9UKJ8 722 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ROS1P08922 2347 aa13.11□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 FFAR1O14842 300 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 SLC43A1O75387 559 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 MT-ND1P03886 318 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ASAH2BP0C7U1 165 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ADORA3P0DMS8 318 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 BSPH1Q075Z2 132 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 KEAP1Q14145 624 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 KRT72Q14CN4 511 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 IFI44LQ53G44 452 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 PHYHD1Q5SRE7 291 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CARD17Q5XLA6 110 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 GLYATQ6IB77 296 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 P2RY8Q86VZ1 359 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM123Q8N131 208 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM239Q8WW34 195 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 LINC00470Q9BZP3 86 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 NANSQ9NR45 359 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 SLC17A5Q9NRA2 495 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 TAS2R5Q9NYW4 299 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CD300AQ9UGN4 299 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF229Q9UJW7 825 aa13.1□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF587BE7ETH6 402 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CLOCKO15516 846 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 KRT33AO76009 404 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 OR7A10O76100 309 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 PRSS23O95084 383 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 IFNW1P05000 195 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 THRBP10828 461 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 UMPSP11172 480 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 AHCYP23526 432 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 RBM34P42696 430 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ST3GAL3Q11203 375 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ACKR1Q16570 336 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 FXNQ16595 210 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 HIKESHIQ53FT3 197 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 FKBP9P1Q75LS8 142 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ALPK2Q86TB3 2170 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 DEFB107AQ8IZN7 70 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 OFCC1Q8IZS5 231 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 KBTBD8Q8NFY9 601 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 OR1K1Q8NGR3 316 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 NEUROG1Q92886 237 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 MUCL1Q96DR8 90 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CDRT15Q96T59 188 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 NELFAQ9H3P2 528 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 NGBQ9NPG2 151 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa13.09□□□□□ -0.31
CSAG1-202ENST00000370287 CADP27708 2225 aa13.08□□□□□ -0.32
CSAG1-202ENST00000370287 SLC35F4A4IF30 521 aa13.08□□□□□ -0.32
CSAG1-202ENST00000370287 OR6C65A6NJZ3 312 aa13.08□□□□□ -0.32
CSAG1-202ENST00000370287 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CSAG1-202ENST00000370287 CD3EP07766 207 aa13.08□□□□□ -0.32
CSAG1-202ENST00000370287 HSD17B1P14061 328 aa13.08□□□□□ -0.32
CSAG1-202ENST00000370287 FUT1P19526 365 aa13.08□□□□□ -0.32
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF83P51522 516 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms