RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NID1P14543 1247 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NCK1P16333 377 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF4P43489 277 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PRLHRP49683 370 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GPLD1P80108 840 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF616Q08AN1 781 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BCL7AQ4VC05 210 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 VWA2Q5GFL6 755 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR5D16Q8NGK9 328 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 YIPF5Q969M3 257 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR5B2Q96R09 309 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ATP5SQ99766 215 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CUTCQ9NTM9 273 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FBXL12Q9NXK8 326 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ERI3O43414 337 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IGHG1P01857 330 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 T-ENOLP0DO92 83 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TNFSF8P32971 234 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SPINT3P49223 89 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2KP61086 200 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ERVS71-1P61550 626 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ARF1P84077 181 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IRF9Q00978 393 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GRIN2CQ14957 1233 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR8B8Q15620 311 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CTSL3PQ5NE16 218 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 AADACL2Q6P093 401 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TAS1R3Q7RTX0 852 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SUMF1Q8NBK3 374 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR4K5Q8NGD3 323 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 THEM6Q8WUY1 208 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TFAP2BQ92481 460 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 IGF2P01344 180 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FAM209AQ5JX71 171 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ESX1Q8N693 406 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 GLYATL2Q8WU03 294 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SMPDL3BQ92485 455 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 MVB12AQ96EY5 273 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ASF1BQ9NVP2 202 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV6A0A075B6T7 132 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BCL2L11O43521 198 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DUX1O43812 170 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C6orf47O95873 294 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 JMJD7P0C870 316 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PYCR1P32322 319 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF85Q03923 595 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PHF19Q5T6S3 580 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 UEVLDQ8IX04 471 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PGBD5Q8N414 524 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM229BQ8NBD8 167 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR8G5Q8NG78 346 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 SYNPRQ8TBG9 265 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM239Q8WW34 195 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC120Q96HB5 630 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PGAM5Q96HS1 289 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 NCKAP5O14513 1909 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 LINC00862A6NCI5 91 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 AADACP22760 399 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PER3P56645 1201 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 OR8G1Q15617 311 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 EXT1Q16394 746 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf27AQ580R0 203 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 XKR7Q5GH72 579 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRD-201ENST00000355233 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms