RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 APOOLQ6UXV4 268 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FTMTQ8N4E7 242 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR56B4Q8NH76 319 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 Q9N2J8 555 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.63□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 KNL1Q8NG31 2342 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 AIPO00170 330 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 KRT33AO76009 404 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GLCEO94923 617 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MAS1P04201 325 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 FBXO45P0C2W1 286 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF250P15622 560 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GABRG2P18507 467 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CDK2P24941 298 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MST1P26927 711 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 GPR3P46089 330 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 P2RX1P51575 399 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 BLVRAP53004 296 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CTXN1P60606 82 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GRM7Q14831 915 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 LINC00303Q3SY05 128 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ELOA3Q8NG57 546 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 NXPE2Q96DL1 559 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC120Q96HB5 630 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 AMELYQ99218 206 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 OR10A5Q9H207 317 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 POMT2Q9UKY4 750 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 V9GY05 133 aa6.62□□□□□ -1.35
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PTPRR-202ENST00000342084 MYO9BQ13459 2157 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 COL4A2P08572 1712 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CDC14CA4D256 554 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 TNFRSF10CO14798 259 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CTDSPLO15194 276 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 DOK2O60496 412 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 PRAMEF2O60811 474 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 UPK3AO75631 287 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 AKR7A3O95154 331 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 SEMA4FO95754 770 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 CLPSP04118 112 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-202ENST00000342084 ALDOBP05062 364 aa6.62□□□□□ -1.35
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