RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 FNDC7Q5VTL7 733 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 STAC2Q6ZMT1 411 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 Q6ZTK2 550 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 Q96M85 177 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 DGAT2Q96PD7 388 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 FLVCR2Q9UPI3 526 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ACOT7O00154 380 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 RABIFP47224 123 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 P2RX1P51575 399 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 BLVRAP53004 296 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 PUDPQ08623 228 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM69Q5SWH9 247 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 SLITRK2Q9H156 845 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 UBQLN2Q9UHD9 624 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 SDHAP31040 664 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 GRK6P43250 576 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 JAZF1Q86VZ6 243 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 OR13H1Q8NG92 308 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 RBP7Q96R05 134 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1B0GVT2 93 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 TUBAL3A6NHL2 446 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 LINC01565O15544 149 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 SNAPC5O75971 98 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 IL5P05113 134 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ART1P52961 327 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 GRK1Q15835 563 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ELOA3BQ3SY89 546 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 APOOLQ6UXV4 268 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 LRRTM1Q86UE6 522 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 CDC20BQ86Y33 519 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF615Q8N8J6 731 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ELOA3Q8NG57 546 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 MNTQ99583 582 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 OR10A5Q9H207 317 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 OR10A4Q9H209 315 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 BEX1Q9HBH7 125 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 TCF7L1Q9HCS4 588 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 TAS2R5Q9NYW4 299 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 KLK11Q9UBX7 282 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 IFNGR1P15260 489 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ADRA2CP18825 462 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 CFPP27918 469 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 AQP2P41181 271 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 EMC4Q5J8M3 183 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 STPG1Q5TH74 334 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 LIPNQ5VXI9 398 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 NUP54Q7Z3B4 507 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF511Q8NB15 262 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 OR5AK2Q8NH90 309 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 FKBP7Q9Y680 259 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 SNRPGP15A8MWD9 76 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 CLDN4O14493 209 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF432O94892 652 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 PDGFAP04085 211 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 GIPP09681 153 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 ASAH2BP0C7U1 165 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD1-201ENST00000331462 OR8G3PP0DMU2 310 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms