RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 PLPP3O14495 311 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 SLC43A1O75387 559 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 ADORA3P0DMS8 318 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 HLA-DOBP13765 273 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 DNASE1P24855 282 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 LOXP28300 417 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 UGT2B15P54855 530 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 GABRA6Q16445 453 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 PAMR1Q6UXH9 720 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 OR52N5Q8NH56 324 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 PFN4Q8NHR9 129 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 TMEM239Q8WW34 195 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 HS6ST2Q96MM7 605 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 UBTD1Q9HAC8 227 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 RHCGQ9UBD6 479 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 A4GNTQ9UNA3 340 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 NOX1Q9Y5S8 564 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.12■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 A0A1W2PR80 420 aa22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 UPK3AO75631 287 aa22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 MT-ND1P03886 318 aa22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 KEAP1Q14145 624 aa22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 LRRC17Q8N6Y2 441 aa22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 NINJ1Q92982 152 aa22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 MED31Q9Y3C7 131 aa22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 POLQO75417 2590 aa22.11■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 B2RBV5 119 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 J3KTA2 159 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 RAF1P04049 648 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 HSD17B1P14061 328 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 HOXC12P31275 282 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 IST1P53990 364 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 CARD17Q5XLA6 110 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 SSX8Q7RTT4 187 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 PXKQ7Z7A4 578 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 GPR137CQ8N3F9 429 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 SGTBQ96EQ0 304 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 MUS81Q96NY9 551 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 EMC6Q9BV81 110 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 LINC00470Q9BZP3 86 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 MED29Q9NX70 200 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 ZNF432O94892 652 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 PIK3C3Q8NEB9 887 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 TXNDC15Q96J42 360 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 OR2M2Q96R28 347 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 CD300AQ9UGN4 299 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 V9GYQ6 96 aa22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 CLOCKO15516 846 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 RNF13O43567 381 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 OR7A10O76100 309 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 CD3EP07766 207 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 TRAM2Q15035 370 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 NCMAPQ5T1S8 102 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 KLHL24Q6TFL4 600 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 C17orf78Q8N4C9 275 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 GORASP2Q9H8Y8 452 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 C20orf141Q9NUB4 165 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 TAS2R5Q9NYW4 299 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 RNF115Q9Y4L5 304 aa22.08■■□□□ 1.13
PDF-201ENST00000288022 CSMD2Q7Z408 3487 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 SLC35F4A4IF30 521 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 ZNF726A6NNF4 738 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 PIP5K1CO60331 668 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 PLAUP00749 431 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 ASAH2BP0C7U1 165 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 FUT1P19526 365 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 CALB2P22676 271 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 ART1P52961 327 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 BSPH1Q075Z2 132 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 LINGO2Q7L985 606 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 TMEM123Q8N131 208 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 ANKK1Q8NFD2 765 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 SLC17A5Q9NRA2 495 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 NPAP1Q9NZP6 1156 aa22.07■■□□□ 1.12
PDF-201ENST00000288022 AMDHD2Q9Y303 409 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.2 ms