RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 UPRTQ96BW1 309 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MYH4Q9Y623 1939 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FADS1O60427 444 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 GMDSO60547 372 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 UTS2O95399 124 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LPLP06858 475 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35A1P78382 337 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G7Q13093 441 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LANCL3Q6ZV70 420 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MED25Q71SY5 747 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A24Q8N4F4 322 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 NUMA1Q14980 2115 aa19.56■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 DDAH2O95865 285 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PRKACAP17612 351 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 IL2RGP31785 369 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 HTR5AP47898 357 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL2Q9UKC9 423 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TMED7Q9Y3B3 224 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 RNF212BA8MTL3 300 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 STEAP1BQ6NZ63 245 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 NANOGP1Q8N7R0 232 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZBP1Q9H171 429 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PLPP1O14494 284 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA7P05543 415 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FCGR2AP12318 317 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LBX1P52954 281 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FCN2Q15485 313 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CCSMST1Q4G0I0 132 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA6CQ9H3T2 930 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PPT2Q9UMR5 302 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PLSCR5A0PG75 271 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO24O75426 580 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 BCL6P41182 706 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 RPL34P49207 117 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ACSM1Q08AH1 577 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN3Q16667 212 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF684Q5T5D7 378 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 NKAIN3Q8N8D7 197 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 STACQ99469 402 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 STEAP1Q9UHE8 339 aa19.55■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 HTD2P86397 168 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 FAPQ12884 760 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A11Q8NCK7 471 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 OR6M1Q8NGM8 313 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A10A0PJK1 596 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC2LP0C7M8 214 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC2P0DI81 140 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TRAPPC2BP0DI82 140 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PCSK6P29122 969 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CCR9P51686 369 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PLGLAQ15195 96 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC2DQ9UHP7 191 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MSTNO14793 375 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SHOXO15266 292 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SCRG1O75711 98 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 STK17BO94768 372 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ERVFC1P60507 584 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SRPXP78539 464 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TEKQ02763 1124 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MFAP5Q13361 173 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TANGO2Q6ICL3 276 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CD300LGQ6UXG3 332 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CREB3L2Q70SY1 520 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ADIPOR2Q86V24 386 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 OR51D1Q8NGF3 324 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 TAAR8Q969N4 342 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PDXPQ96GD0 296 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A18Q96N87 628 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ZIC5Q96T25 663 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 POM121CA8CG34 1229 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 CEBPZOSA8MTT3 80 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 KCNK2O95069 426 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB2P05107 769 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MSR1P21757 451 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B7P56937 341 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 HAS2Q92819 552 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 RAB39BQ96DA2 213 aa19.54■□□□□ 0.72
CCSAP-201ENST00000284617 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms