RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 COTL1Q14019 142 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 LINGO2Q7L985 606 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 STOML3Q8TAV4 291 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 JAM3Q9BX67 310 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MYO10Q9HD67 2058 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 OBP2AQ9NY56 170 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SERTM1A2A2V5 107 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MAN2B1O00754 1011 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SBK2P0C263 348 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NR2C1P13056 603 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CD53P19397 219 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CHIT1Q13231 466 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 GFOD2Q3B7J2 385 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 AVL9Q8NBF6 648 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SH3BGRLO75368 114 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CPT2P23786 658 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 P2RY2P41231 377 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 WASP42768 502 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 GPR1P46091 355 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 HGFACQ04756 655 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CPTPQ5TA50 214 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CDC73Q6P1J9 531 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MRGPREQ86SM8 312 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 OR52I2Q8NH67 350 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 C19orf12Q9NSK7 152 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TMEM100Q9NV29 134 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ANGPT4Q9Y264 503 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 FARS2O95363 451 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SLC16A8O95907 504 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 RAB5AP20339 215 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CNTN1Q12860 1018 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 BIKQ13323 160 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NAE1Q13564 534 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TRAM1Q15629 374 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 FAM27D1Q5T7N8 215 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 C3orf49Q96BT1 292 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PIGQQ9BRB3 760 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.1■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SYT5O00445 386 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PCDH8O95206 1070 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 KAT7O95251 611 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 APBB3O95704 486 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CDH11P55287 796 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 CAMKMTQ7Z624 323 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 RFKQ969G6 155 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TNFSF18Q9UNG2 199 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 DOCK9Q9BZ29 2069 aa20.09■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MED6O75586 246 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 IMPA1P29218 277 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 GLP1RP43220 463 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SMIM11AP58511 58 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NHLH2Q02577 135 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PJVKQ0ZLH3 352 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SDR9C7Q8NEX9 313 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 OR5D16Q8NGK9 328 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 MED8Q96G25 268 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 TMEM231Q9H6L2 316 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 F5P12259 2224 aa20.08■□□□□ 0.81
PITX1-201ENST00000265340 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PITX1-201ENST00000265340 ATF1P18846 271 aa20.08■□□□□ 0.8
PITX1-201ENST00000265340 ACKR3P25106 362 aa20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms