RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 ACTC1P68032 377 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ACTA1P68133 377 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PSG6Q00889 435 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 GOSR2O14653 212 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PIN1P1O15428 100 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 HCRTR2O43614 444 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CBX7O95931 251 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PTGS2P35354 604 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 OR1D4P47884 311 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ART1P52961 327 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CAMK2DQ13557 499 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 OPCMLQ14982 345 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 C1QL3Q5VWW1 255 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ULK3Q6PHR2 472 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 BMFQ96LC9 184 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CAMK2AQ9UQM7 478 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 TRANK1O15050 2925 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 IFITM5A6NNB3 132 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 SDC3O75056 442 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 SPARCP09486 303 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 OR2T7P0C7T2 308 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 GLB1L2Q8IW92 636 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 OR2T27Q8NH04 317 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 KLHDC3Q9BQ90 382 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ATG5Q9H1Y0 275 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CYP8B1Q9UNU6 501 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa12.26□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0B4J2E0 115 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GX12 115 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PPL8 197 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 C2orf74A8MZ97 194 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PRR32B1ATL7 298 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ITGA10O75578 1167 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 HLA-DQB1P01920 261 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 HHEXQ03014 270 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ALG11Q2TAA5 492 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ALG10Q5BKT4 473 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 SLC22A10Q63ZE4 541 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 BTN2A1Q7KYR7 527 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 OR4D10Q8NGI6 311 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 MED30Q96HR3 178 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 SEC22AQ96IW7 307 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 EXO5Q9H790 373 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 DUSP22Q9NRW4 184 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 SLC22A13Q9Y226 551 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2QL1A1L167 161 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 SEC14L5O43304 696 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 OIP5O43482 229 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 MEP1BQ16820 701 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CD276Q5ZPR3 534 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 JAGN1Q8N5M9 183 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 DUSP19Q8WTR2 217 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PBX4Q9BYU1 374 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CENPMQ9NSP4 180 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 SCML1Q9UN30 329 aa12.25□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PLXNA2O75051 1894 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 COL4A3Q01955 1670 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 K7EQS6 105 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 M0QYG6 137 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CTNSO60931 367 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 PTP4A3O75365 173 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 RBBP9O75884 186 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 THBS1P07996 1170 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 EN2P19622 333 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 MNDAP41218 407 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ZP1P60852 638 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ACTA2P62736 377 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ACTG2P63267 376 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 KIR2DS3Q14952 304 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CA13Q8N1Q1 262 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF321PQ8N8H1 164 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 CHST4Q8NCG5 386 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 FAM46BQ96A09 425 aa12.24□□□□□ -0.45
TMOD1-201ENST00000259365 TGM7Q96PF1 710 aa12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms