RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa27.89■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CSAG2Q9Y5P2 127 aa27.89■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ASPMQ8IZT6 3477 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC13O75165 2243 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WXM4 84 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPB13A6NJU9 1138 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPB4C9JG80 1138 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC14L5O43304 696 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM20BO75063 409 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SHC1P29353 583 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SDHAP31040 664 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEA5P43359 124 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC10A1Q14973 349 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 NXNL2Q5VZ03 156 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM122BQ7Z309 247 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 RFKQ969G6 155 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP21Q9H596 190 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PNR3 127 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 RNF13O43567 381 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 PAICSP22234 425 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2B6P58173 313 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A087WV48 116 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PNV4 684 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM166BA8MTA8 275 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 XPNPEP2O43895 674 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ENTPD6O75354 484 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35A2P78381 396 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM154Q6P9G4 183 aa27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 ASB18Q6ZVZ8 466 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF540Q8NDQ6 660 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 MFRPQ9BY79 579 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 F13BP05160 661 aa27.85■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PDSS1Q5T2R2 415 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC39A7Q92504 469 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC14L4Q9UDX3 406 aa27.85■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A18Q3C1V0 323 aa27.84■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0J9YW62 118 aa27.83■■■□□ 2.05
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CAPNS1-206ENST00000588815 EFCAB10A6NFE3 127 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM64CA6NLI5 447 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf98E9PRG8 122 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR7A3O95154 331 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A10O95528 541 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 OPN1LWP04000 364 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM18P0DKX4 95 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-206ENST00000588815 PIPP12273 146 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
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