RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 TGFBR3Q03167 851 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RBBP4Q09028 425 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SELPLGQ14242 412 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MAPRE2Q15555 327 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ADRM1Q16186 407 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SHEQ5VZ18 495 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ULK3Q6PHR2 472 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SSX8Q7RTT4 187 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RETREG3Q86VR2 466 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 KDM8Q8N371 416 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DPP10Q8N608 796 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 OR52N5Q8NH56 324 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PIP5K1AQ99755 562 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SH3GL1Q99961 368 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ECSITQ9BQ95 431 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 VCX3BQ9H321 246 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 RASD1Q9Y272 281 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 GMEB1Q9Y692 573 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 ACANP16112 2415 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-214ENST00000583153 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 DPRXA6NFQ7 191 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 M0R1B8 84 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MRASO14807 208 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ENTPD5O75356 428 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MFN2O95140 757 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF43P17038 809 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 COX5AP20674 150 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 HTR2AP28223 471 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF83P51522 516 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 BSPH1Q075Z2 132 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 KLF10Q13118 480 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 OR1Q1Q15612 314 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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PTPRM-214ENST00000583153 NIPAL3Q6P499 406 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRM-214ENST00000583153 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PTOV1Q86YD1 416 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF611Q8N823 705 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NRG4Q8WWG1 115 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRM-214ENST00000583153 SLC38A4Q969I6 547 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FBXW5Q969U6 566 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRM-214ENST00000583153 LRRC58Q96CX6 371 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 EPYCQ99645 322 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MCHR1Q99705 422 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf10Q9HB07 376 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 GID8Q9NWU2 228 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 DSCAMO60469 2012 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 M0R3H8 397 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 FBP2O00757 339 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 ABCD4O14678 606 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 AIM2O14862 343 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 NPIPB7O75200 414 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 PTNP21246 168 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-214ENST00000583153 MPGP29372 298 aa7.32□□□□□ -1.24
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