RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 AGAP5A6NIR3 686 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM229AB2RXF0 380 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 HMGN4O00479 90 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 FAAHO00519 579 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 PPIHO43447 177 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 SYNGR3O43761 229 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 IL7RP16871 459 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ACHEP22303 614 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ARRB2P32121 409 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ARR3P36575 388 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 LIMS1P48059 325 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 SEC24CP53992 1094 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 DEFA6Q01524 100 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 HOMEZQ8IX15 550 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 KIF18AQ8NI77 898 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 RDH5Q92781 318 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ESM1Q9NQ30 184 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 RLIMQ9NVW2 624 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 FZR1Q9UM11 496 aa15.07■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 VAMP5O95183 116 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ADRA2CP18825 462 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 CEACAM16Q2WEN9 425 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 RNF130Q86XS8 419 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 MNS1Q8NEH6 495 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 NEURL3Q96EH8 262 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 DPY30Q9C005 99 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 GPR35Q9HC97 309 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 RASD1Q9Y272 281 aa15.06■□□□□ 0
CCDC40-211ENST00000574099 A8MVM7 634 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 NCR1O76036 304 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 NR4A1P22736 598 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 LMO4P61968 165 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 GNA13Q14344 377 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 LRP11Q86VZ4 500 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 IFT20Q8IY31 132 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 OR8J2Q8NGG1 315 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 MS4A5Q9H3V2 200 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 G6PC2Q9NQR9 355 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.05■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 SLC43A1O75387 559 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 HLA-HP01893 362 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 PNMTP11086 282 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 EMX2Q04743 252 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 GSTA3Q16772 222 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 ALKBH6Q3KRA9 238 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 ATG16L1Q676U5 607 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 VRK2Q86Y07 508 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 ZDHHC22Q8N966 263 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 C22orf15Q8WYQ4 148 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 APOPT1Q96IL0 206 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF747Q9BV97 191 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 NOX1Q9Y5S8 564 aa15.04■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF432O94892 652 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 MPZL1O95297 269 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 AHSA1O95433 338 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 BCL10O95999 233 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 TFPTP0C1Z6 253 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 NAT2P11245 290 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 CD79AP11912 226 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF43P17038 809 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 EVX1P49640 407 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 MYBPC1Q00872 1141 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 PIGFQ07326 219 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 AVPI1Q5T686 147 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 ANXA8L1Q5VT79 327 aa15.03■□□□□ -0
CCDC40-211ENST00000574099 WBP2NLQ6ICG8 309 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms