RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TAAR8Q969N4 342 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 LINC00470Q9BZP3 86 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 C12orf10Q9HB07 376 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 B3GAT1Q9P2W7 334 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 FZD7O75084 574 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF432O94892 652 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF43P17038 809 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TUBA1BP68363 451 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TUBA4AP68366 448 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 MST1LQ2TV78 715 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TUBA1AQ71U36 451 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 FBXO17Q96EF6 278 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 OXGR1Q96P68 337 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 NELFAQ9H3P2 528 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 IKZF5Q9H5V7 419 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 GMEB1Q9Y692 573 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 A0A096LPE4 126 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 A0A1W2PPZ6 126 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 M0R082 166 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 OR2T1O43869 369 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 BMP4P12644 408 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 EFNA4P52798 201 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 SWI5Q1ZZU3 235 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 FAM69AQ5T7M9 428 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF417Q8TAU3 575 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 FAM168AQ92567 244 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 SLC38A4Q969I6 547 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 RCE1Q9Y256 329 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 AIM2O14862 343 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 LY6HO94772 140 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 CBLP22681 906 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 GRPRP30550 384 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 SCARB2Q14108 478 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 AGKQ53H12 422 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TTMPQ5BVD1 217 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ALG10BQ5I7T1 473 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD16Q6P6B7 361 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 KRT73Q86Y46 540 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 SLC43A1O75387 559 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 SLC25A16P16260 332 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 GPX2P18283 190 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ARF1P84077 181 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM249Q2WGJ8 235 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 C5orf46Q6UWT4 87 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 C10orf105Q8TEF2 133 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 KCNS3Q9BQ31 491 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 WFDC6Q9BQY6 131 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 SEC61A2Q9H9S3 476 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-209ENST00000567771 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 A8MV72 311 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 CRYAAP02489 173 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 CECR9P0C854 216 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 PAX7P23759 505 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 AQP1P29972 269 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 ATP4BP51164 291 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 NAAAQ02083 359 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 C1DQ13901 141 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 ADRM1Q16186 407 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 ULK3Q6PHR2 472 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 GPR35Q9HC97 309 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 F12P00748 615 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 SLC6A2P23975 617 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 CALCRP30988 508 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 SQLEQ14534 574 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 OR1Q1Q15612 314 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 C6orf52Q5T4I8 152 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-209ENST00000567771 FAM91A1Q658Y4 838 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms