RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565324.5

SMG1-211, Transcript of SMG1, nonsense mediated mRNA decay associated PI3K related kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMG1, Length 12,465 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1-211ENST00000565324 ZNF566Q969W8 418 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 RGPD1P0DJD0 1748 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ZNF724A8MTY0 619 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ACSM4P0C7M7 580 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 FGF7P21781 194 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 HNF1BP35680 557 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TESK1Q15569 626 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TP53I3Q53FA7 332 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 Q6ZRG5 221 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 C14orf80Q86SX3 495 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 OR2L13Q8N349 312 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 PGBD5Q8N414 524 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TRIB1Q96RU8 372 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SLC22A12Q96S37 553 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 C11orf49Q9H6J7 331 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 BCO1Q9HAY6 547 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 LILRB3O75022 631 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ACKR3P25106 362 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 RPS26P62854 115 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 OR4D1Q15615 310 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 DHRS11Q6UWP2 260 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CPXM2Q8N436 756 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CLEC1AQ8NC01 280 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 IRF7Q92985 503 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TVP23CQ96ET8 276 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 LPAR4Q99677 370 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 GPR34Q9UPC5 381 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 YIPF1Q9Y548 306 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SDK1Q7Z5N4 2213 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 MROH1Q8NDA8 1641 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 LY86O95711 162 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 DEFA4P12838 97 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 GDNFP39905 211 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CCL23P55773 120 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TAS2R45P59539 299 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 FAM180BQ6P0A1 224 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 BPIFCQ8NFQ6 507 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TMEM106AQ96A25 262 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SLC25A46Q96AG3 418 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CXorf58Q96LI9 332 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ATF6BQ99941 703 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ZFP92A6NM28 416 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 XRCC3O43542 346 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 DBHP09172 617 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SMIM17P0DL12 118 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TRNP1Q6NT89 227 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SLC35D2Q76EJ3 337 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 DIO2Q92813 273 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 KCNJ15Q99712 375 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SGPP1Q9BX95 441 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SLC6A20Q9NP91 592 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CNIH4Q9P003 139 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 FAM166BA8MTA8 275 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ZNF727A8MUV8 499 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SPINT2O43291 252 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 TCRBP04435 133 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 HMGCLP35914 325 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 OR10A3P58181 314 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 REEP5Q00765 189 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 Q1RN00 199 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 OR13C5Q8NGS8 318 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 SPACA1Q9HBV2 294 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 FEZF1A0PJY2 475 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 LRRC30A6NM36 301 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 HOXB2P14652 356 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 CBR1P16152 277 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 INHBCP55103 352 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 DOC2AQ14183 400 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 ESPL1Q14674 2120 aa4.75□□□□□ -1.65
SMG1-211ENST00000565324 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.75□□□□□ -1.65
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