RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 AVPI1Q5T686 147 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 CPTPQ5TA50 214 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 OR4C11Q6IEV9 310 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 NEPROQ6NW34 567 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.12□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 Q6ZSV7 163 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 H2AFVQ71UI9 128 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 FCRLAQ7L513 359 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 SPATA21Q7Z572 469 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 TMEM86BQ8N661 226 aa3.12□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 OR4N2Q8NGD1 307 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 FAM167BQ9BTA0 163 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 MS4A8Q9BY19 250 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 HSD3B7Q9H2F3 369 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 EHD1Q9H4M9 534 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 MARCH7Q9H992 704 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 PLLPQ9Y342 182 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 AUP1Q9Y679 476 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 C1orf226A1L170 272 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ZNF724A8MTY0 619 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 SCO2O43819 266 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 GMFGO60234 142 aa3.11□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 SH3BGRLO75368 114 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 GUCA1CO95843 209 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 GAS8O95995 478 aa3.11□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 NPY2RP49146 381 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 XKP51811 444 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 AP1S2P56377 157 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 STX5Q13190 355 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 HERPUD1Q15011 391 aa3.11□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 NPSR1Q6W5P4 371 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 RNF144BQ7Z419 303 aa3.11□□□□□ -1.91
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HERC1-211ENST00000560983 SLC43A2Q8N370 569 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 OTUD6BQ8N6M0 293 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ZNF527Q8NB42 609 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 NUP37Q8NFH4 326 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC1-211ENST00000560983 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
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