RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560335.5

NUMB-232, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMB-232ENST00000560335 EDNRAP25101 427 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CFPP27918 469 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CD1CP29017 333 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 UQCRC1P31930 480 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ARL4DP49703 201 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 PGDP52209 483 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 SLC37A1P57057 533 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 PPP1CAP62136 330 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 HSD11B2P80365 405 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 DMWDQ09019 674 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TNK1Q13470 666 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 PLA1AQ53H76 456 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ALG10Q5BKT4 473 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TSSK4Q6SA08 328 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 FAM122BQ7Z309 247 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 OR5J2Q8NH18 312 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 LMX1AQ8TE12 382 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 NSMAFQ92636 917 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 HYLS1Q96M11 299 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 OR2M2Q96R28 347 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ALG12Q9BV10 488 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ADAM19Q9H013 955 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 MMP25Q9NPA2 562 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 LANCL2Q9NS86 450 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 GNG8Q9UK08 70 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TMEM131Q92545 1883 aa6.5□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 A0A0G2JMP0 313 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 A0A0X1KG70 313 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 A0A1B0GVI7 797 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TMEM212A6NML5 194 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ALG1L2C9J202 215 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 E9PI62 339 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 HCRTR1O43613 425 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 SCO2O43819 266 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ADAM11O75078 769 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 OR2B3O76000 313 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 UTS2O95399 124 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CLPSP04118 112 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CYC1P08574 325 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 SRMP19623 302 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 MAOAP21397 527 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 IL12BP29460 328 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ACVR1BP36896 505 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 GZMKP49863 264 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 MAP2K6P52564 334 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CAPZA1P52907 286 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 PNLIPRP2P54317 469 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 E2F1Q01094 437 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 FAPQ12884 760 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 C1orf61Q13536 156 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 GPR176Q14439 515 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TOMM20Q15388 145 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CARTPTQ16568 116 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 NTRK2Q16620 822 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 Q499Y3 187 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 CD276Q5ZPR3 534 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 LEG1Q6P5S2 330 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 GPR135Q8IZ08 494 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 GHDCQ8N2G8 530 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 D2HGDHQ8N465 521 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.49□□□□□ -1.37
NUMB-232ENST00000560335 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms