RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 VWC2LB2RUY7 222 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NR5A2O00482 541 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 UBDO15205 165 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 OR2T1O43869 369 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NPIPB7O75200 414 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SNNO75324 88 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SLC43A1O75387 559 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 UPK3AO75631 287 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PDE5AO76074 875 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 TGFAP01135 160 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SRD5A1P18405 259 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 HNF1AP20823 631 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SELENOPP49908 381 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 P2RY4P51582 365 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MVDP53602 400 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NAAAQ02083 359 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 LGALS3BPQ08380 585 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RGNQ15493 299 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ADIPOQQ15848 244 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 VHLLQ6RSH7 139 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SERPINA11Q86U17 422 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 C3orf49Q96BT1 292 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZBTB9Q96C00 473 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 OXGR1Q96P68 337 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PLK3Q9H4B4 646 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SLC6A13Q9NSD5 602 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 C5orf58C9J3I9 102 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CLIC1O00299 241 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 FRS3O43559 492 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CECR9P0C854 216 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PNMTP11086 282 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CBR1P16152 277 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ARR3P36575 388 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CLDN17P56750 224 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 HOXC5Q00444 222 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 IL1RL1Q01638 556 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 EFNB3Q15768 340 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 KDM8Q8N371 416 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NUP37Q8NFH4 326 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SLC35B4Q969S0 331 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 VPS33AQ96AX1 596 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 TMEM19Q96HH6 336 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 CHODLQ9H9P2 273 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 GPR35Q9HC97 309 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 BCL2L10Q9HD36 194 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 RCE1Q9Y256 329 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.09□□□□□ -1.27
COCH-211ENST00000557065 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 TMEM120BA0PK00 339 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 SLC35F4A4IF30 521 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 AIM2O14862 343 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ZNF432O94892 652 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 IGLV1-44P01699 117 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 DAOP14920 347 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 ZNF23P17027 643 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 NPR2P20594 1047 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 CALCRP30988 508 aa7.08□□□□□ -1.28
COCH-211ENST00000557065 PPOXP50336 477 aa7.08□□□□□ -1.28
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