RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF43	P17038	809 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CTSS	P25774	331 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	GRPR	P30550	384 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	UGT2B15	P54855	530 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PUDP	Q08623	228 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PMPCA	Q10713	525 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ZP4	Q12836	540 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	COX10	Q12887	443 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MICA	Q29983	383 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	OAF	Q86UD1	273 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1W2PNV4	684 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		H0YC42	278 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	LRRTM2	O43300	516 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TIPRL	O75663	272 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	YES1	P07947	543 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	NR2C1	P13056	603 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FPR3	P25089	353 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CHRNB4	P30926	498 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	LIMS1	P48059	325 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PXK	Q7Z7A4	578 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1W2PRG6	482 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		G3V2T6	193 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		M0R082	166 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	AKR7A3	O95154	331 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ADA	P00813	363 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ADORA3	P0DMS8	318 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	AHCY	P23526	432 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TSPAN31	Q12999	210 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RTL6	Q6ICC9	239 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	GPAT4	Q86UL3	456 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	FUZ	Q9BT04	418 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	C8orf4	Q9NR00	106 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730		U3KQV3	271 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	PLPP3	O14495	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	RNF13	O43567	381 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ENTPD5	O75356	428 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	TGM6	O95932	706 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	OMP	P47874	163 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ERF	P50548	548 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ZBED5	Q49AG3	693 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BBS1-224	ENST00000534730	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23

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