RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528246.5

MSRA-210, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRA, Length 1,706 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-210ENST00000528246 BIKQ13323 160 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 OVCH2Q7RTZ1 564 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 GLRX5Q86SX6 157 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 CA13Q8N1Q1 262 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 OR52I2Q8NH67 350 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 ZNF417Q8TAU3 575 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 WBP1Q96G27 269 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 GFI1Q99684 422 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 GABRG3Q99928 467 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 GNG8Q9UK08 70 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa9.4□□□□□ -0.9
MSRA-210ENST00000528246 A0A1B0GVC2 190 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 A6NIN4 97 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 LRRC72A6NJI9 287 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 C2orf74A8MZ97 194 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 H7C417 338 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 XRCC3O43542 346 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 GMDSO60547 372 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 AQP8O94778 261 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 CSF1P09603 554 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 CD96P40200 585 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 CENPAP49450 140 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 SELENOPP49908 381 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 P2RX1P51575 399 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 ADPRHP54922 357 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 EGR3Q06889 387 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 GPM6BQ13491 265 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 FDX2Q6P4F2 183 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 TMEM65Q6PI78 240 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 CDH26Q8IXH8 852 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 MEIOBQ8N635 442 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 EXD3Q8N9H8 876 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 OR13C5Q8NGS8 318 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 GRHL3Q8TE85 626 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 WDR92Q96MX6 357 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 POT1Q9NUX5 634 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 MTFP1Q9UDX5 166 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 A0A0J9YY10 115 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 UBE2QL1A1L167 161 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 H0YGG7 62 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 GLSO94925 669 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 ZFPL1O95159 310 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 S1PR1P21453 382 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 VEGFCP49767 419 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 YPEL5P62699 121 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 APOOLQ6UXV4 268 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 Q6ZTK2 550 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 FCRLAQ7L513 359 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 OR4K13Q8NH42 304 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.39□□□□□ -0.91
MSRA-210ENST00000528246 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms