RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 MUC7Q8TAX7 377 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SHC3Q92529 594 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 VPS33AQ96AX1 596 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAB39BQ96DA2 213 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMIM10Q96HG1 83 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CITED1Q99966 193 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SEC22CQ9BRL7 303 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1orf50Q9BV19 199 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CACNG6Q9BXT2 260 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACPTQ9BZG2 426 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAPBQ9H115 298 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 C20orf85Q9H1P6 137 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 LY9Q9HBG7 655 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACOXLQ9NUZ1 547 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL20RAQ9UHF4 553 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CBY1Q9Y3M2 126 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNX8Q9Y5X2 465 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 MICAL3Q7RTP6 2002 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 HTR3EA5X5Y0 456 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SIGLEC16A6NMB1 481 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 G3V4G9 280 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 MFNGO00587 321 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 BPY2O14599 106 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CASKO14936 926 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GMNNO75496 209 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GABARAPO95166 117 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 H6PDO95479 791 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXCL14O95715 111 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAPSAO96009 420 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 BCHEP06276 602 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SFTPBP07988 381 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CTSGP08311 255 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC35G4P0C7Q5 338 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATF6P18850 670 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TBXA2RP21731 343 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SHMT2P34897 504 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GALR1P47211 349 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSNK1A1P48729 337 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SRP54P61011 504 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC7A9P82251 487 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SRYQ05066 204 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GINS1Q14691 196 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 COG2Q14746 738 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 STXBP2Q15833 593 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NDUFA9Q16795 377 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DEFB115Q30KQ5 88 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM95Q3KNT9 176 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM205BPQ63HN1 556 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TIGD3Q6B0B8 471 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPR139Q6DWJ6 353 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ACSM5Q6NUN0 579 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 PODNL1Q6PEZ8 512 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CBLN3Q6UW01 205 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 C4orf50Q6ZRC1 276 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC22A16Q86VW1 577 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CALHM1Q8IU99 346 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 MISPQ8IVT2 679 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 AQP12AQ8IXF9 295 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 CCDC36Q8IYA8 594 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 THNSL1Q8IYQ7 743 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DNASE1L2Q92874 299 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR34Q96EX3 536 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 DEFB118Q96PH6 123 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR5B2Q96R09 309 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 SDF4Q9BRK5 362 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM246Q9BRR3 403 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NAT9Q9BTE0 207 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ABCG5Q9H222 651 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF385DQ9H6B1 395 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 GLRX2Q9NS18 164 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-287P-201ENST00000516230 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms