RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	FCRL1	Q96LA6	429 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF225	Q9UK10	706 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	NEU3	Q9UQ49	428 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	TOM1	O60784	492 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	FMO3	P31513	532 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	UNC119	Q13432	240 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ZMYND11	Q15326	602 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	CEP55	Q53EZ4	464 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	GPR157	Q5UAW9	335 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	PAQR7	Q86WK9	346 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	3.19	□□□□□ -1.9	2e-7	■■■■■ 62.8
SKAP2-208	ENST00000495802	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	AZI2	Q9H6S1	392 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	SIAE	Q9HAT2	523 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	GIN1	Q9NXP7	522 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	COX16	Q9P0S2	106 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ASB3	Q9Y575	518 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	BTBD17	A6NE02	478 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	TNFSF13	O75888	250 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	MOS	P00540	346 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ABO	P16442	354 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	TBP	P20226	339 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	EPS15	P42566	896 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	CYTH1	Q15438	398 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	MPPED2	Q15777	294 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	MKX	Q8IYA7	352 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	SHC3	Q92529	594 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF799	Q96GE5	643 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	GBA3	Q9H227	469 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	PPA2	Q9H2U2	334 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	NIPAL2	Q9H841	368 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	IL26	Q9NPH9	171 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	HYPK	Q9NX55	129 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF639	Q9UID6	485 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	LTBP1	Q14766	1721 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A1B0GUA9	196 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	CD1C	P29017	333 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	CDH4	P55283	916 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	ACVR1	Q04771	509 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	GNMT	Q14749	295 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	DGUOK	Q16854	277 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	COX15	Q7KZN9	410 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	NT5C3B	Q969T7	300 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2M2	Q96R28	347 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	PANX2	Q96RD6	677 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	FMO2	Q99518	471 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	LY9	Q9HBG7	655 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SKAP2-208	ENST00000495802	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9

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