RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, human

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX17-208	ENST00000493711		M0R082	166 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PLPP3	O14495	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	GPR171	O14626	319 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PRKACG	P22612	351 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ACVR2A	P27037	513 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	GPR4	P46093	362 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	RAD23A	P54725	363 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ESRRG	P62508	458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	LTB	Q06643	244 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PUDP	Q08623	228 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	DAG1	Q14118	895 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PON3	Q15166	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM225	Q6GV28	225 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	FCRLA	Q7L513	359 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	CD163	Q86VB7	1156 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ATCAY	Q86WG3	371 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	CBR4	Q8N4T8	237 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	RDH12	Q96NR8	316 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TEX12	Q9BXU0	123 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	KRT84	Q9NSB2	600 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	EMC3	Q9P0I2	261 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711		A0A1W2PNV4	684 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711		H0YC42	278 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	CDC42EP2	O14613	210 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	CYTIP	O60759	359 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PTP4A3	O75365	173 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	WISP2	O76076	250 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	AKR7A3	O95154	331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	NDUFB2	O95178	105 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ALPL	P05186	524 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	CRH	P06850	196 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TSPAN19	P0C672	248 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ADORA3	P0DMS8	318 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	OSM	P13725	252 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PTN	P21246	168 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	IGFBP5	P24593	272 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	UQCRC1	P31930	480 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	SLC16A1	P53985	500 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PPP2R2B	Q00005	443 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	POU4F3	Q15319	338 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PXK	Q7Z7A4	578 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	RNF128	Q8TEB7	428 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	OXGR1	Q96P68	337 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TRIB1	Q96RU8	372 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	RNF122	Q9H9V4	155 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711		A0A1W2PRG6	482 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711		H0YJX3	145 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	PDLIM1	O00151	329 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	EI24	O14681	340 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	IDH3B	O43837	385 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	POU2F1	P14859	743 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	ZNF43	P17038	809 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	SLC6A6	P31641	620 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNX17-208	ENST00000493711	TIMP3	P35625	211 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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