RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ALG10BQ5I7T1 473 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 FAM69AQ5T7M9 428 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 FBXL14Q8N1E6 418 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 OR10H5Q8NGA6 315 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SLC38A4Q969I6 547 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 MAGEB18Q96M61 343 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 OBP2BQ9NPH6 170 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 RCE1Q9Y256 329 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 H7C417 338 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 M0R082 166 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SSX4O60224 188 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 MFN2O95140 757 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 CLDN17P56750 224 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SELPLGQ14242 412 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 FAM91A1Q658Y4 838 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 NHLRC1Q6VVB1 395 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 KRT73Q86Y46 540 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 DEPDC4Q8N2C3 294 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 DPP10Q8N608 796 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF417Q8TAU3 575 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 HTRA1Q92743 480 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 OXGR1Q96P68 337 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 CORO2BQ9UQ03 480 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 MOKQ9UQ07 419 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 A0A087WUJ7 227 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0B4J2E0 115 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1B0GX12 115 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 OR6C65A6NJZ3 312 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 WNT11O96014 354 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 AQP1P29972 269 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 GRPRP30550 384 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 MST1LQ2TV78 715 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ULK3Q6PHR2 472 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 C5orf46Q6UWT4 87 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SLC41A3Q96GZ6 507 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 FKRPQ9H9S5 495 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ATP23Q9Y6H3 246 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 MS4A18H0YCH9 400 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 OR2T1O43869 369 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 HPRP00739 348 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SLC6A2P23975 617 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 MS4A18Q3C1V0 323 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL24Q6TFL4 600 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM123Q8N131 208 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 HIPK4Q8NE63 616 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD27Q96NW4 1050 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 EVPLLA8MZ36 301 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 AIM2O14862 343 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 KRT33AO76009 404 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 IGLV1-44P01699 117 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 BGLAPP02818 100 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF43P17038 809 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 PPP2R2BQ00005 443 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 OR1Q1Q15612 314 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SWI5Q1ZZU3 235 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 DHDDSQ86SQ9 333 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 WDFY1Q8IWB7 410 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ANKK1Q8NFD2 765 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SLC38A2Q96QD8 506 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 SEC61A2Q9H9S3 476 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 PRORSD1PA6NEY8 169 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 EDF1O60869 148 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 NUDT6P53370 316 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 TUBA1BP68363 451 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 TUBA4AP68366 448 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 PHYHD1Q5SRE7 291 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD16Q6P6B7 361 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 TUBA1AQ71U36 451 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-211ENST00000490677 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms