RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490332.2

PTPRK-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-213	ENST00000490332	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332		Q9N2J8	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332		V9GYH0	126 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332		A0A0B4J2E0	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332		A0A1B0GX12	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332		H0YIG0	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SGK494	L7N484	410 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	WWP2	O00308	870 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	GABRP	O00591	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	BHLHE40	O14503	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	IMPA2	O14732	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ARPC3	O15145	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	P2RX6	O15547	441 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	FRS3	O43559	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	RNF13	O43567	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PLPP2	O43688	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SNAPC5	O75971	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	TPPP	O94811	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	TNFSF15	O95150	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	NDUFB2	O95178	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	LYPD3	O95274	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CH25H	O95992	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	THY1	P04216	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PNMT	P11086	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CEL	P19835	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	MYL9	P24844	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ITGA3	P26006	1051 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CFP	P27918	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	DDOST	P39656	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CASP3	P42574	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	GPR4	P46093	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	HTR3A	P46098	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	RFX3	P48380	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CENPA	P49450	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	NRG3	P56975	720 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PRPS1	P60891	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	DCAF7	P61962	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	BTG1	P62324	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ACTA2	P62736	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ACTG2	P63267	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PITPNA	Q00169	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	FABP5	Q01469	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	MXD1	Q05195	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	IL10RA	Q13651	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PON3	Q15166	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ELOC	Q15369	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPRK-213	ENST00000490332	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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