RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486260.5

THBS3-207, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 5

Gene THBS3, Length 1,763 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-207ENST00000486260 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 IL20Q9NYY1 176 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 AQP7P3A6NL99 342 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 C11orf98E9PRG8 122 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 MS4A18H0YCH9 400 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 RCBTB2O95199 551 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 OR6A2O95222 327 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 EDN3P14138 238 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 AHCYP23526 432 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 PON3Q15166 354 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 RFX4Q33E94 735 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 EMC4Q5J8M3 183 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 OR8D4Q8NGM9 314 aa14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
THBS3-207ENST00000486260 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CLCA1A8K7I4 914 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 SYNGR4O95473 234 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 F13BP05160 661 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TPOP07202 933 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CRISP1P54107 249 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 PUDPQ08623 228 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 NPRL3Q12980 569 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ALG10Q5BKT4 473 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TMEM225Q6GV28 225 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 MBOAT4Q96T53 435 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 GTF3C1Q12789 2109 aa14.77□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 RNF13O43567 381 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 NDUFB2O95178 105 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ABOP16442 354 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 PRPS1P60891 318 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ESRRGP62508 458 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 GPAT4Q86UL3 456 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 AHRRA9YTQ3 701 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 MCIDASD6RGH6 385 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 SERPINI2O75830 405 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 HLA-DOBP13765 273 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ZP4Q12836 540 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TAF11Q15544 211 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TMEM236Q5W0B7 351 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 FCRLAQ7L513 359 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CD163Q86VB7 1156 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ZNF570Q96NI8 536 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 RDH12Q96NR8 316 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TRIB1Q96RU8 372 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 AQP8O94778 261 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 TGM6O95932 706 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 SLC6A6P31641 620 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CTXN1P60606 82 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 KATNB1Q9BVA0 655 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 IFT27Q9BW83 186 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 INIPQ9NRY2 104 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 RASD1Q9Y272 281 aa14.75□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 A0A1W2PNV4 684 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 H0YJX3 145 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 CYTIPO60759 359 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 PPP1R3DO95685 299 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 GIPRP48546 466 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ERVK-25P63136 954 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 GINS1Q14691 196 aa14.74□□□□□ -0.05
THBS3-207ENST00000486260 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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