RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 PDLIM1O00151 329 aa11.43□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 ABCD4O14678 606 aa11.43□□□□□ -0.58
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HPS1-211ENST00000478087 NPIPB7O75200 414 aa11.43□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 GPIP06744 558 aa11.43□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
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HPS1-211ENST00000478087 C16orf89Q6UX73 402 aa11.43□□□□□ -0.58
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HPS1-211ENST00000478087 OR2T12Q8NG77 320 aa11.42□□□□□ -0.58
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HPS1-211ENST00000478087 MFN2O95140 757 aa11.4□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 PNMTP11086 282 aa11.4□□□□□ -0.58
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HPS1-211ENST00000478087 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.4□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.4□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 SMYD1Q8NB12 490 aa11.4□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 STK35Q8TDR2 534 aa11.4□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 TMEM45BQ96B21 275 aa11.4□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
HPS1-211ENST00000478087 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
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