RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RASD1Q9Y272 281 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 KIF26BQ2KJY2 2108 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TTLL8A6PVC2 850 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 H3BN98 237 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 INMTO95050 263 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PTHP01270 115 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SBK2P0C263 348 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CXCR1P25024 350 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 DCTDP32321 178 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RGS6P49758 472 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RAC1P63000 192 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 HIST1H3AP68431 136 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF85Q03923 595 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 FOXF1Q12946 379 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 NNATQ16517 81 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 C10orf128Q5T292 105 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 HIST2H3AQ71DI3 136 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF627Q7L945 461 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TIGD4Q8IY51 512 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PHYHIPQ92561 330 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RORBQ92753 470 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ADNPQ9H2P0 1102 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 GP6Q9HCN6 339 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SLC35F4A4IF30 521 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RIIAD1A6NNX1 92 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 WWP2O00308 870 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PLPP2O43688 288 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 AQP8O94778 261 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ABHD16AO95870 558 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 BCL10O95999 233 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CELA2AP08217 269 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CCL3P10147 92 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RRADP55042 308 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CDH11P55287 796 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TAS2R43P59537 309 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 GABREP78334 506 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ROM1Q03395 351 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CLN3Q13286 438 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 INAQ16352 499 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ALG10Q5BKT4 473 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 GGNQ86UU5 652 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 BEST3Q8N1M1 668 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM156Q8N614 296 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 NANSQ9NR45 359 aa5.8□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 GJE1A6NN92 205 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SULT1C4O75897 302 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 VAMP5O95183 116 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SPI1P17947 270 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 CRYBB2P43320 205 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ETV1P50549 477 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 DAP3P51398 398 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 FOXL2P58012 376 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 EGR3Q06889 387 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 NFATC3Q12968 1075 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 AQP6Q13520 282 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 AHSA2Q719I0 299 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SLC16A9Q7RTY1 509 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 OR6X1Q8NH79 312 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PTGES2Q9H7Z7 377 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 INIPQ9NRY2 104 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 RASSF1Q9NS23 344 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 POLHQ9Y253 713 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 NINQ8N4C6 2090 aa5.79□□□□□ -1.48
PRKCI-202ENST00000476635 A0A075B6Q4 140 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms