RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463317.6

VAMP7-204, Transcript of vesicle associated membrane protein 7, human

TSL 5

Gene VAMP7, Length 673 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAMP7-204	ENST00000463317	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	DDO	Q99489	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317		Q9N2J8	555 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317		A0A1W2PQD3	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	DNPH1	O43598	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	TOX4	O94842	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PSMG1	O95456	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	CLIC3	O95833	236 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	CHRM4	P08173	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	FBP1	P09467	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	GABRB3	P28472	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	BTG1	P62324	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	TPM4	P67936	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	MYL5	Q02045	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	NR1I3	Q14994	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	CCNG2	Q16589	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317		Q8N2B8	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	LHX4	Q969G2	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	C22orf46	C9J442	243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	STK16	O75716	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PMS2P2	O95744	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	NUDT14	O95848	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	KLK1	P06870	262 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ADH4	P08319	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	HSPA7	P48741	367 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	P2RX1	P51575	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SELENOV	P59797	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	TRAF3	Q13114	568 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VAMP7-204	ENST00000463317	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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