RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.91□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 CMAHPQ9Y471 501 aa8.91□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC154A6NI56 674 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 B4DSR2 109 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 M0R233 179 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 ITM2AO43736 263 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV3-15P01624 115 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 BCHEP06276 602 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 GSNP06396 782 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 PNMTP11086 282 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 P2RY4P51582 365 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 RIN1Q13671 783 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 CHI3L2Q15782 390 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 COX20Q5RI15 118 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 CARD17Q5XLA6 110 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 EPHX4Q8IUS5 362 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 NUDCD3Q8IVD9 361 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 CCDC115Q96NT0 180 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 ZIM3Q96PE6 472 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 DOK1Q99704 481 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 SYT3Q9BQG1 590 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 NUF2Q9BZD4 464 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 NOX3Q9HBY0 568 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 HIF1ANQ9NWT6 349 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 P2RX2Q9UBL9 471 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 USP22Q9UPT9 525 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 NOX1Q9Y5S8 564 aa8.9□□□□□ -0.98
DDX39B-211ENST00000449757 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.9□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 A0A096LPI6 279 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CDHR4A6H8M9 788 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 M0R3G1 203 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 MYZAPP0CAP1 466 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CD79AP11912 226 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CBR1P16152 277 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CREB1P16220 341 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 LBPP18428 481 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 ARR3P36575 388 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CDKN2CP42773 168 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 ALDH3B1P43353 468 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM186Q96B77 213 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 BOD1Q96IK1 185 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 ZBTB18Q99592 522 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 GPR35Q9HC97 309 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 SEC14L4Q9UDX3 406 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 FZR1Q9UM11 496 aa8.89□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 A0A0A6YYJ9 748 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PPW3 197 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM129A0AVI4 362 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM247A6NEH6 219 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 FAM157AC9JC47 383 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 TRIM77I1YAP6 450 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 AIM2O14862 343 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 SYNGR3O43761 229 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 ANP32DO95626 131 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 KRT75O95678 551 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 TFP02787 698 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 SERPINE1P05121 402 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 MSMBP08118 114 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 TFPTP0C1Z6 253 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 PRG2P13727 222 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CBLP22681 906 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CRATP43155 626 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 CRISP3P54108 245 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 UFM1P61960 85 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 HOXC5Q00444 222 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 GALK2Q01415 458 aa8.88□□□□□ -0.99
DDX39B-211ENST00000449757 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms