RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASD1Q9Y272 281 aa15.18■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa15.17■□□□□ 0.02
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.15■□□□□ 0.02
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OXGR1Q96P68 337 aa15.15■□□□□ 0.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KATNB1Q9BVA0 655 aa15.15■□□□□ 0.02
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa15.15■□□□□ 0.02
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf98E9PRG8 122 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPIPA3F8WFD2 350 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 MPZL2O60487 215 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R3DO95685 299 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHMP01871 453 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SDHAP31040 664 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 DAP3P51398 398 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 TDGF1P3P51864 188 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSF1Q00613 529 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 POU4F3Q15319 338 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCSK4Q6UW60 755 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 FCRLAQ7L513 359 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 UEVLDQ8IX04 471 aa15.14■□□□□ 0.01
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