RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 HTR3EA5X5Y0 456 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 GGT2P36268 569 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 RAC3P60763 192 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 CDK20Q8IZL9 346 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 GPA33Q99795 319 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 ZAR1LA6NP61 321 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 PRRG2O14669 202 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 MAKP20794 623 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 GPR4P46093 362 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35A1P78382 337 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC17Q8N6Y2 441 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 ZPLD1Q8TCW7 415 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 NANSQ9NR45 359 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 MYRFQ9Y2G1 1151 aa26.47■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 AHRRA9YTQ3 701 aa26.46■■□□□ 1.83
ECHS1-201ENST00000368547 MT-ATP6P00846 226 aa26.46■■□□□ 1.83
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ECHS1-201ENST00000368547 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa26.45■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 SAGP10523 405 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 PON3Q15166 354 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD21Q4G0X4 260 aa26.44■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 DEPDC4Q8N2C3 294 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SEC14L4Q9UDX3 406 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SCOCQ9UIL1 159 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF229Q9UJW7 825 aa26.44■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa26.43■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 CD47Q08722 323 aa26.43■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 TRIB1Q96RU8 372 aa26.43■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 SYNGR4O95473 234 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ASAH2BP0C7U1 165 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ENPP1P22413 925 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 IL5RAQ01344 420 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 PAQR6Q6TCH4 344 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF786Q8N393 782 aa26.43■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF417Q8TAU3 575 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 FNDC9Q8TBE3 224 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 LIPHQ8WWY8 451 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ROBO4Q8WZ75 1007 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ASPNQ9BXN1 380 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CORINQ9Y5Q5 1042 aa26.43■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM64A6NGJ6 449 aa26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF814B7Z6K7 855 aa26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 H3BN98 237 aa26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
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ECHS1-201ENST00000368547 TEKQ02763 1124 aa26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.828e-9■■■■■ 57
ECHS1-201ENST00000368547 IGFBP7Q16270 282 aa26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 SLX4IPQ5VYV7 408 aa26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 C3P1Q6ZMU1 363 aa26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 IL20Q9NYY1 176 aa26.42■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 CDC42P60953 191 aa26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 BLMHQ13867 455 aa26.41■■□□□ 1.82
ECHS1-201ENST00000368547 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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