RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 DLK1P80370 383 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CACNG1Q06432 222 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ELP6Q0PNE2 266 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 TAF10Q12962 218 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 DGCR6Q14129 220 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CCL14Q16627 93 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CCL15Q16663 113 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CDKN3Q16667 212 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 HKDC1Q2TB90 917 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 KLHL26Q53HC5 615 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CDKL4Q5MAI5 379 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 C6orf183Q5T699 404 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 GPRC6AQ5T6X5 926 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 TTC23LQ6PF05 361 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 AHSA2Q719I0 299 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 DEFB132Q7Z7B7 95 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 VTCN1Q7Z7D3 282 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 GALNT10Q86SR1 603 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 TLK2Q86UE8 772 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD46Q86W74 232 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 STK40Q8N2I9 435 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 FRMD1Q8N878 549 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 LPCAT1Q8NF37 534 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PIK3R3Q92569 461 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 FCGR1BQ92637 280 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PROX1Q92786 737 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 MYDGFQ969H8 173 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 FBXO32Q969P5 355 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 TESCQ96BS2 214 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 RNF170Q96K19 258 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 COPS4Q9BT78 406 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CENPOQ9BU64 300 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 GABARAPL3Q9BY60 117 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ACPTQ9BZG2 426 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 NACA2Q9H009 215 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 GNB4Q9HAV0 340 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 RDH14Q9HBH5 336 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 KRT84Q9NSB2 600 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SPASTQ9UBP0 616 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 LHX3Q9UBR4 397 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 Q9Y3F1 56 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 FRMPD3Q5JV73 1810 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 EP400Q96L91 3159 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ACOD1A6NK06 481 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 EVPLLA8MZ36 301 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 F5H5T6 163 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 M0QZ92 97 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 RFXANKO14593 260 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PHOX2AO14813 284 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA0513O60268 411 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CLDN11O75508 207 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 GPX5O75715 221 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 STK16O75716 305 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 UGT2B17O75795 530 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 LRATO95237 230 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 GJB5O95377 273 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PTHP01270 115 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ANXA8P13928 327 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SDC1P18827 310 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PRPS1L1P21108 318 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 S100A5P33763 92 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 HMGCLP35914 325 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 DDOSTP39656 456 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SLC15A1P46059 708 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 RGS6P49758 472 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 RGS4P49798 205 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 SGSHP51688 502 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms