RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CLVS2Q5SYC1 327 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RAB39BQ96DA2 213 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OR5K3A6NET4 321 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LIPCP11150 499 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RPS25P62851 125 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 DUSP7Q16829 419 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PHYHIPQ92561 330 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF286AQ9HBT8 521 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GLTPQ9NZD2 209 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO7Q9Y3I1 522 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 IL32P24001 234 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MTNR1BP49286 362 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RPP30P78346 268 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ACTBL2Q562R1 376 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM255BQ8WV15 326 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM59Q9BXS4 323 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 A8MVM7 634 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TEAD1P28347 426 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MTCP1P56278 107 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 KRBOX4Q5JUW0 171 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PARM1Q6UWI2 310 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD4Q8TB40 342 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 UBQLN3Q9H347 655 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ACKR4Q9NPB9 350 aa18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM202A6NGA9 273 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLC34A2O95436 690 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN6P56747 220 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 STACQ99469 402 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ADPRHP54922 357 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GPLD1P80108 840 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 HYAL4Q2M3T9 481 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM23O75077 832 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV3-27P01718 113 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 HTR2CP28335 458 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RBPJQ06330 500 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF750Q32MQ0 723 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf28Q4W4Y0 310 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf135Q5VTT2 229 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 DLEU7Q6UYE1 221 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 WDSUB1Q8N9V3 476 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF610Q8N9Z0 462 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OLIG1Q8TAK6 271 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PDFQ9HBH1 243 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ16Q9NPI9 418 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GPR171O14626 319 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM61Q5EBN2 209 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 BEST4Q8NFU0 473 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OR5T1Q8NG75 326 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 KCNG3Q8TAE7 436 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF681Q96N22 645 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GAREM1Q9H706 876 aa18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLC14A1Q13336 389 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF684Q5T5D7 378 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC18Q8N456 261 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A17Q9H1V8 727 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PTTG3PQ9NZH4 202 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 DAPP1Q9UN19 280 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GX78 115 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 LIM2P55344 173 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 BIDP55957 195 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PYCR3Q53H96 274 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OR52N1Q8NH53 320 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 KIF25Q9UIL4 384 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN11A1L157 253 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 K7ESM1 405 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 AP1G1O43747 822 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 DDAH2O95865 285 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM240Q5SV17 173 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 KDM4DQ6B0I6 523 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MS4A6EQ96DS6 147 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 GIMAP5Q96F15 307 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 CENPOQ9BU64 300 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SOCS6O14544 535 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 UBL3O95164 117 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 MYOGP15173 224 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 ABOP16442 354 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 SFXN4Q6P4A7 337 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 NRARPQ7Z6K4 114 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 OR6V1Q8N148 313 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms