RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351205.8

SMN1-201, Transcript of survival of motor neuron 1, telomeric, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMN1, Length 900 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1-201ENST00000351205 GTF2H4Q92759 462 aa14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 BEX2Q9BXY8 128 aa14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 SEC61A2Q9H9S3 476 aa14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 TMEM160Q9NX00 188 aa14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 VWC2LB2RUY7 222 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 CLIC1O00299 241 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 ZNF432O94892 652 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 CECR9P0C854 216 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 BMP2P12643 396 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 ZNF43P17038 809 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 PAX7P23759 505 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 PDLIM4P50479 330 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 CLDN17P56750 224 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 NAAAQ02083 359 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 FADDQ13158 208 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 GGTLC2Q14390 218 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 BBS10Q8TAM1 723 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 SLC35B4Q969S0 331 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 RCE1Q9Y256 329 aa14.66□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 NDUFS8O00217 210 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 FZD7O75084 574 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 IGLV1-44P01699 117 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 OR4A8P0C604 315 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 CALCRP30988 508 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 ADIPOQQ15848 244 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 VHLLQ6RSH7 139 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.65□□□□□ -0.06
SMN1-201ENST00000351205 B9A039 149 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 C5orf58C9J3I9 102 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 M0R082 166 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 PDE5AO76074 875 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 IGKV3-15P01624 115 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 CELA3BP08861 270 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 HTR2AP28223 471 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 NR4A2P43354 598 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 GZMKP49863 264 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 EFNB3Q15768 340 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 CARTPTQ16568 116 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 COMTD1Q86VU5 262 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 ZNF417Q8TAU3 575 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 TAAR8Q969N4 342 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 TLCD1Q96CP7 247 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 OXGR1Q96P68 337 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 PRR14Q9BWN1 585 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 PLK3Q9H4B4 646 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 C12orf10Q9HB07 376 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.64□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 A0A1B0GWA3 101 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 AIM2O14862 343 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 LMX1BO60663 402 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 SLC43A1O75387 559 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 ETS2P15036 469 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 IGFBP5P24593 272 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 GRPRP30550 384 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 PRKAR1BP31321 381 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 EPGNQ6UW88 154 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.63□□□□□ -0.07
SMN1-201ENST00000351205 C10orf111Q8N326 155 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms